眼科是山东省临床重点专科、山东省卫生健康委员会医药卫生重点学科（眼底病学）、山东省临床精品特色专科（眼外伤专科）、枣庄市医药卫生重点学科（角膜病学、眼底病学），为国家食品药品监督管理总局认定的药物临床试验机构眼科学专业基地、全国干眼规范化诊疗中心星级单位、眼眶病眼肿瘤专科联盟单位、山东省眼科医疗质量控制中心副主任单位、枣庄市眼科医疗质量控制中心主任单位、枣庄市医学会眼科专业委员会主委单位、枣庄市眼科专科联盟牵头单位。眼科包含门诊、病房、屈光治疗中心、青少年视力低下防治中心。病房分为2个病区，开放床位共57张，年门诊量8万余人次，年出院患者4000余人次。

科室目前专业细化，包含白内障、屈光、青光眼、眼底病、斜弱视及小儿眼病、眼表与角膜病、眼整形、眼外伤八大亚专科，开展各种类型的手术及治疗。其中开展的特色技术包括微小切口白内障超声乳化联合三焦点、全视程及散光多焦点人工晶体植入术、有晶体眼后房型人工晶体（ICL）植入术、微创全飞秒激光手术、个性化角膜屈光手术、干眼综合检测、M22-OPT（优化脉冲光技术）治疗干眼症，微创青光眼手术（MIGs）、25G万速高速玻璃体切除术、复杂眼外伤二期玻璃体视网膜手术及前后节联合眼内结构重建手术、植入性囊袋拉钩囊袋固定术治疗晶状体脱位、巩膜层间缝纫机技术治疗睫状体离断、人工晶体微创双针无缝线巩膜层间固定术、生物羊膜移植治疗严重眼化学伤、Yokoyama手术治疗重眼综合征、多次斜视手术后继发性斜视和残余性斜视的个性化诊治、眼眶深部肿物切除术、微脉冲激光联合玻璃体腔注药治疗黄斑水肿、飞蚊症激光消融术、眼底病的多模式影像诊断等。

科室拥有高精尖设备，包括蔡司VisuMax全飞秒激光手术平台、爱尔康wavelight Fs200+Ex500屈光手术平台、Sirius角膜地形图、Centurion超声乳化手术系统、Constellation玻璃体切割白内障超声乳化一体机、master700生物测量仪、海德堡Spectralis多模式影像平台、法国光太EasyRet 577nm眼底激光治疗仪 、蔡司真彩高清超广角眼底成像系统、OPT强脉冲激光等。

科室承担全市眼科医疗质量控制的检查、分析与培训等工作，每年举办省市级继续教育活动，承办枣庄市医学会眼科专业委员会学术年会、枣庄市眼科质控中心工作会议；承担济宁医学院本科生的临床教学、实习、带教工作，接收其他医院医生进修学习，持续派出医生进行对口技术支援及帮扶；主持及参与多个国家级研究项目，承担省市级科研课题数10余项，在国内外杂志发表论文15篇，编写或参与编写专著13部；6名医师曾在英国、德国、美国、意大利、韩国等交流学习。